FigTree软件
FigTree是一款用于进化生物学的进化树作图软件,主要用于制作生物进化系统树,并且支持多种形式进化树,支持有颜色设置、名称更改等功能,帮助进化生物学科研人员制作轻松完成进化树的制作,以用户相关学术文献的撰写。
1、打开软件
2、使用file -> open功能打开树文件,出现以下对话
3、选择“确定”
4、可以看出需要对数的末端字体进行设置,在左边选择tip labels -> Font进行设置
5、设置字体,大小,是否斜体加粗
6、选择左上角polartree layout按钮
7、初步设置环形系统发育树
8、为了美观我们需要对齐末端,选择Align tip labels
9、如果对其中的某个支系感兴趣,可以对其进行阴影标记,选择好感兴趣的支系
10、选择顶端Highlight按钮,选择颜色
11、初步效果
12、如果要调整阴影部分的位置,可以使用root angle的大小,作用拖动调整
13、最终效果如下