BioEdit软件下载
BioEdit是一款多功能的DNA序列比对编辑分析软件，支持多种简单的序列比对编辑和操作以及一些基本的序列分析，例如：序列比对、序列检索、引物设计、系统发育分析等，这些都是研究DNA的生物学科研人员常用的功能。
1、四种手动对齐模式：选择和滑动，动态抓取和拖动，间隙插入和鼠标单击删除，以及屏幕输入，其行为类似于文本编辑器。
2、使用单独的核酸和氨基酸颜色表进行颜色对齐和编辑，并完全控制背景颜色。
3、用于从DNA序列自动生成质粒载体图形的质粒绘图界面。轻松标记位置，添加箭头和弯曲框的功能，并标记限制酶切位点。还显示了多接头的细节，并使用绘图工具绘制可移动的箭头和形状。
4、基于动态信息的对齐着色。
5、点击式颜色表编辑
6、显示和打印具有专业外观输出的ABI色谱图。
7、将序列分组成组或家族。
8、锁定分组序列的对齐以进行同步手对齐调整。
9、使用图形特征注释序列，在对齐窗口中包含动态视图，包括特征注释信息工具提示。
10、锁定序列以防止意外编辑。
11、指定被认为对氨基酸和核苷酸序列的计算有效的字符。
12、按名称，LOCUS，DEFINITION，ACCESSION，PID / NID，REFERENCES，COMMENTS或所选列中的残留频率对序列进行排序。
13、通过参考序列合并比对。
14、将一个对齐添加到另一个的末尾。
15、基本的系统发育树查看器(用于phylip格式树)，允许节点翻转和打印。
16、在单序列编辑器中口头回读序列以验证手工输入的序列条目。
17、读写Genbank，Fasta，Phylip 3.2，Phylip 4和NBRF / PIR格式。现在还读取GCG和Clustal格式
18、利用Don Gilbert的ReadSeq自动导入和导出其他11种格式，包括MSF，ASN.1，IG / Stanford和EMBL。
19、允许直接从剪贴板导入兼容格式，而无需先保存到文件。
20、轻松自定义编辑器窗口的菜单快捷方式
21、RNA比较分析，包括协变，潜在配对和互信息分析(目前能够生成高达10,000 x 10,000的矩阵 - 但这将是一个600+ Mb文件)，带有用于二维矩阵输出表的矩阵绘图仪和面积绘图数据矩阵的各行。矩阵绘图仪和折线图都有点击数据选择，矩阵绘图仪和矩阵数据的一维线图现在动态链接
22、使用绘图仪查看非常大的矩阵的部分(在最高5183 x 5183矩阵= 180 Mb文件上测试)
23、查看和操作最多20,000个序列的比对。
24、用于快速打开和保存大型比对的二进制文件格式(BioEdit项目格式) - 原始16S rRNA比对(29 Mb文件)的6205序列在233 MHz Pentium上打开并在不到10秒的时间内保存。
25、使用用户定义的首选项进行ORF搜索
26、具有密码子使用概要的核酸序列的格式化翻译，一个或三个字母的氨基酸编码的选择，仅核酸的选定区域的翻译，以及起始/终止密码子的选择
27、拆分窗口视图，用于同时和同步编辑同一文件中的两个不同位置 - 垂直或水平拆分窗口
28、氨基酸和核苷酸组成分析和图
29、通过氨基酸翻译使编码蛋白质的核酸序列对齐。
30、ClustalW多序列比对(界面内部，Des Higgins等人的外部程序)具有比对蛋白质完整标题和GenBank字段信息的自动更新，以及当从核苷酸序列的蛋白质视图比对时的核苷酸编码序列。
31、蛋白质疏水性/亲水性图
32、蛋白质疏水矩矩阵图(0-180 dgrees)
33、现在可在编辑窗口中选择全部系统字体
34、使用任何或所有帧翻译，多种酶选择和输出选项以及环状DNA功能进行限制性作图
35、按制造商浏览限制酶
36、可以操纵至少4.6 Mb长度的序列(到目前为止测试的最大序列是大肠杆菌基因组(4.6 Mb) - 打开大肠杆菌，反向补充，翻译成10,125个密码子序列> = 100个氨基酸，并且打开并保存完整的GenBank注释)。
37、能够对整个基因组进行原始翻译的六帧翻译(用大肠杆菌基因组测试 - 大约4.6 Mb)
38、使用LOCUS，DEFINITION，ACCESSION，PID，NID，DBSOURCE，KEYWORDS，SOURCE，REFERENCE，COMMENT和FEATURES字段保存GenBank格式的Entrez文件。修改或添加您自己的信息。以GenBank格式保存的多个序列文件保留所有输入的信息。此信息也以BioEdit Project文件格式保存。
39、通过BioEdit图形应用程序配置界面配置和运行附件应用程序
40、完整的NCBI包本地BLAST程序，数据库创建和互联网BLAST客户端2.0，以及大肠杆菌开放阅读框的样本蛋白质数据库。
41、具有标识和相似性(用于蛋白质)着色和几种格式选项的着色图形输出。
42、格式化着色对齐的富文本导出
43、在线帮助系统(总是在程序背后的几个版本)。
44、熵(信息缺乏)绘图。
45、多文档界面。
46、基本序列操作(反向/互补，翻译，DNA-> RNA-> DNA)
47、轻松导出文本和配置文本打印。
1、先行安装原英文版软件，再安装本简体中文包后运行主程序即可!
2、本简体中文语言包是在7.0.1基础上汉化的，同时也可以使用于各个版本的BioEdit。因采用外挂语言包形式，故软件中仍有不少地方显示为英文。
1、在BioEdit中开启一个序列
2、而后将序列上方的一个菜单：Mode下拉式菜单改为Edit，将光标移动到序列的最末端，从粘贴板上粘贴你要增加的第二个序列就OK了。这样三个序列都前后连接到一起了。
3、这需要一个一个来，十分麻烦。Mega5软件支持将比对后的序列一下子全部放到此外一个比对后的序列后面。因此在序列连接(或拼接)中，用Mega5比BioEdit更好。要注意的是使用Mega5做连接时，要选择Edit/Build alignment，不能是Edit/view选项，不然不能编辑。
4、文件输出
点击FileSave As，保存为fasta格式，本例保存为123.fasta，覆盖旧文件。
